เมื่อสามารถจำแนกชนิดของจุลินทรีย์ที่มีคุณสมบัติในการกำจัดสารที่เป็นพิษต่อสิ่งแวดล้อมแล้ว จึงเป็นเรื่องที่สะดวกมากขึ้นที่จะนำเอาจุลินทรีย์ชนิดนั้นไปเพาะเลี้ยงและนำกลับมาใช้ในการบำบัดน้ำเสียในโรงงานอุตสาหกรรมที่เป็นแหล่งปล่อยน้ำเสียที่อาจจะมีการปนเปื้อนออกสู่แหล่งน้ำภายนอกต่อไปได้อย่างมีประสิทธิภาพ